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프로토포르피린 IX

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1. 개요

프로토포르피린 IX는 네 개의 피롤 고리로 구성된 포르피린 유도체로, 헴, 엽록소 등 생체 내 중요한 보결분자단의 전구체이다. 'proto-'는 '첫 번째'를 의미하며, 헴의 대체 이름은 철 프로토포르피린 IX(철 PPIX)이다. 프로토포르피린 IX는 자연에서 금속 양이온과 복합체를 이루는 형태로 존재하며, 생합성을 통해 생성된다. 프로토포르피린 IX는 5-아미노레불린산 투여로 인한 형광을 이용하여 교모세포종 수술에 활용되며, 자외선 하에서 붉은색 형광을 낸다.

2. 명명법

일반적인 용어인 프로토포르피린은 네 개의 피롤 고리의 바깥쪽 수소 원자가 다른 작용기로 대체된 포르핀 유도체를 지칭한다. 접두사 "proto"는 과학 명명법에서 종종 '첫 번째'를 의미하며, 일산화탄소 한스 피셔는 프로토포르피린을 최초의 포르피린 종류로 명명한 것으로 여겨진다.[3] 피셔는 철이 제거된 헴이 특히 휴고 카머러의 포르피린과 관련하여 "proto-" 포르피린이 된다고 설명했다.[4][5] 현대에는 'proto-'는 메틸, 비닐, 카르복시에틸/프로피오네이트 곁사슬을 가진 포르피린 종을 구체적으로 나타낸다.

피셔는 또한 15개의 프로토포르피린 유사체를 포함하는 로마 숫자 명명 시스템을 만들었지만, 이 명명 시스템은 체계적이지 않다.[7] 헴의 대체 이름은 철 프로토포르피린 IX(철 PPIX)이다. PPIX는 네 개의 메틸기(-CH3) (M), 두 개의 비닐기(-CH=CH2) (V), 두 개의 프로피온산(-CH2-CH2-COOH) (P)를 포함한다. 접미사 "IX"는 이 곁사슬이 외부 고리 주위에 MV-MV-MP-PM 순서로 c2, c3-c7, c8-c12, c13-c17, c18 위치에 나타남을 의미한다.[7]

PPIX의 메틴기 다리는 알파(c5), 베타(c10), 감마(c15), 델타(c20)로 명명된다. 헴의 맥락에서, 헴 산소화 효소에 의한 대사 생체 변환은 알파-메틴 다리의 선택적 개방으로 이어져 빌리베르딘/빌리루빈을 형성한다. 이 경우, 생성된 빌린은 부모 분자가 알파 위치에서 절단된 프로토포르피린 IX임을 나타내는 접미사 IXα를 갖는다. 비효소적 산화는 다른 다리 위치에서 고리 개방을 초래할 수 있다.[8] 이 맥락에서 그리스 문자의 사용은 1932년 게오르크 바르칸의 선구적인 연구에서 유래되었다.[9]

3. 자연적인 생성

프로토포르피린 IX는 자연에서 내부의 2개의 수소 원자가 2가의 금속 양이온으로 치환된 복합체의 형태로 발견된다. 프로토포르피린 IX이 철(II) 양이온(Fe2+)과 복합체를 이루면 이 형성된다. 몇몇 중요 단백질에서 헴은 보결 분자단으로 작용한다. 이러한 헴을 함유하고 있는 단백질에는 헤모글로빈, 미오글로빈, 사이토크롬 c 등이 있다. 또한 아연과 같은 다른 금속 이온과 결합하여 복합체를 형성할 수도 있다.[22][11]

4. 생합성

프로토포르피린 IX는 자연에서 내부의 2개의 수소 원자가 2가의 금속 양이온으로 치환된 복합체의 형태로 발견된다. 프로토포르피린 IX가 철(II) 양이온(Fe2+)과 복합체를 이루면 이 형성된다. 헴은 헤모글로빈, 미오글로빈, 사이토크롬 c와 같은 일부 중요 단백질에서 보결분자단으로 작용한다. 프로토포르피린 IX는 아연과 같은 다른 금속 이온과 결합하여 복합체를 형성할 수도 있다.[22]

프로토포르피린 IX는 비고리형 전구체로부터 모노피롤(포르포빌리노젠), 테트라피롤(포르피리노젠, 구체적으로 유로포르피리노젠 III)을 거쳐 합성된다. 이러한 대사 중간생성물은 프로토포르피리노젠 IX로 전환된 다음, 프로토포르피리노젠 산화효소에 의해 프로토포르피린 IX로 산화된다.[22] 이 반응은 프로토포르피리노젠 산화효소에 의해 촉매된다.

프로토포르피리노젠 산화효소에 의한 프로토포르피리노젠 IX의 프로토포르피린 IX로의 전환 과정


프로토포르피린 IX는 , 사이토크롬 c, 엽록소와 같은 생물학적으로 필수적인 보결분자단의 중요한 전구체이다. 많은 생물들은 글리신, 석시닐-CoA, 글루탐산과 같은 기본적인 전구체들로부터 이러한 테트라피롤을 합성할 수 있다. 프로토포르피린 IX를 합성하는 생물은 광범위하게 존재하지만, 이 대사 과정은 고등 식물에서 몇 가지 예외를 제외하고 세균에서 포유류에 이르기까지 대부분 보존되어 있다.[23][24][25]

4. 1. 금속 킬레이테이스

이들 분자의 생합성 과정에서 금속 양이온은 킬레이테이스라는 효소에 의해 프로토포르피린 IX로 삽입된다.[23][24][25] 예를 들어, 페로킬레이테이스는 프로토포르피린 IX를 헴 B(Fe-프로토포르피린 IX 또는 프로토헴 IX)로 전환시킨다. 엽록소 생합성에서 마그네슘 킬레이테이스는 프로토포르피린 IX를 Mg-프로토포르피린 IX로 전환시킨다.

5. 합성 유도체

프로토포르피린 IX는 공기 중의 철염과 반응하여 FeCl(PPIX) 착체를 생성한다.[15] 염소와 배위된 헴은 헤민으로 알려져 있다. Fe 외에도 많은 금속이 프로토포르피린 IX(PPIX)와 배위될 때 유사 착체를 형성한다. 특히 흥미로운 것은 산소 운반체로도 기능하는 코발트 유도체이다.[16] 그 외에 니켈, 주석, 크롬 등 다른 금속도 치료적 가치를 위해 연구되었다.[17]

팔레프론은 프로토포르피린 IX의 이나트륨 염이다.[18]

6. 역사

레이들로는 1904년에 프로토포르피린 IX를 처음으로 분리했을 가능성이 있다.[5]

7. 임상적 중요성

5-아미노레불린산(5-ALA) 투여로 인한 프로토포르피린 IX 형광은 교모세포종의 형광 유도 수술에 사용된다.[19][20]

8. 성질

자외선을 이 화합물에 비추면 밝은 붉은색으로 형광을 낸다. 또한 달걀 껍질에 특유의 갈색을 부여하는 성분이기도 하다.[10]

참조

[1] 웹사이트 protoporphyrin IX https://pubchem.ncbi[...]
[2] 논문 Crystal and Molecular Structure of the Free Base Porphyrin, Protoporphyrin IX Dimethyl Ester
[3] 논문 Syntheses and Functionalizations of Porphyrin Macrocycles 2014
[4] 웹사이트 On haemin and the relationships between haemin and chlorophyll https://www.nobelpri[...] 1930
[5] 논문 A short history of porphyrins and the porphyrias https://www.scienced[...] 1980-01-01
[6] 논문 Models for human porphyrias: Have animals in the wild been overlooked? https://onlinelibrar[...] 2020
[7] 논문 Nomenclature of tetrapyrroles. Recommendations 1986 IUPAC-IUB Joint Commission on Biochemical Nomenclature (JCBN) 1988-12-15
[8] 서적 International Symposium on Chemistry and Physiology of Bile Pigments https://books.google[...] U.S. Department of Health, Education, and Welfare, Public Health Service, National Institutes of Health 1977
[9] 논문 A Hæmoglobin from Bile Pigment https://www.nature.c[...] 1938
[10] 논문 Protoporphyrin IX: The Good, the Bad, and the Ugly
[11] 백과사전 Hemes in Biology John Wiley & Sons
[12] 논문 Biosynthesis of the pigments of life: formation of the macrocycle
[13] 논문 The biosynthesis of porphyrins, chlorophylls, and vitamin B12
[14] 논문 Structure and function of enzymes in heme biosynthesis
[15] 서적 Inorganic Syntheses 2007
[16] 논문 Cobalt(II) hematoporphyrin IX and protoporphyrin IX complexes immobilized on highly dispersed titanium(IV) oxide on a cellulose microfiber surface: Electrochemical properties and dissolved oxygen reduction study
[17] 논문 Selection of Metalloporphyrin Heme Oxygenase Inhibitors Based on Potency and Photoreactivity
[18] 웹사이트 Protoporphyrin disodium https://pubchem.ncbi[...] 2021-04-15
[19] 논문 Fluorescence-Guided Surgery in Glioblastoma: 5-ALA, SF or Both? Differences between Fluorescent Dyes in 99 Consecutive Cases 2022-04-26
[20] 논문 Fluorescence-Guided Surgery for High-Grade Gliomas: State of the Art and New Perspectives 2021-01-01
[21] 논문 Crystal and Molecular Structure of the Free Base Porphyrin, Protoporphyrin IX Dimethyl Ester
[22] 백과사전 Hemes in Biology John Wiley & Sons
[23] 논문 Biosynthesis of the pigments of life: formation of the macrocycle
[24] 논문 The biosynthesis of porphyrins, chlorophylls, and vitamin B12
[25] 논문 Structure and function of enzymes in heme biosynthesis
[26] 논문 Iron Porphines



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